The Prophecy -- La Prophétie
*** Les liens de Sydney avec le manuscrit de Rambaldi sont étudiés lors d'une audience du Department of Special Research (DSR)... alors qu'elle se trouve au Brésil, fuyant des hommes armés et des chiens, auxquels elle échappe de justesse.
*** A son retour à Los Angeles, elle est arrêtée par la DSR qui, en tant que branche de la NSA chargé des phénomènes paranormaux, recherche une explication sur la "présence" de Sydney à la page 47 de l'ouvrage de Rambaldi. D'après Vaughn, le texte autour de l'image aurait été partiellement décodé et serait appelé "la prophétie".
La CIA rechigne à coopérer avec la DSR, à l'exception de Hadalki qui fait tout ce qui est en son pouvoir pour aider l'agence rivale. Après une batterie de tests psychiques et intellectuels, les agents de la DSR demandent à Sydney de subir des examens physiques... ce qu'elle refuse.
*** Pendant ce temps, grâce aux photos que Sydney a ramené du Brésil, le SD-6 a identifié l'Homme : il s'agit d'Alexander Khasinau, un allié bien connu de la maffia russe.
*** L'Alliance des 12, qui dirige le SD-6 et les onze autres cellules, a planifié une réunion d'urgence afin de discuter de la situation : doivent-ils déclarer la guerre à Khasinau ou voter une détente ? Sloane est bien sûr favorable à la première solution, mais il est loin d'être sûr de certains votes. Il contacte Edward Poole, le chef du SD-9. Celui-ci l'informe que Jean Briault, un vieil ami de Sloane, a été acheté par Khasinau. Sloane se refuse à croire cela, mais finit par se persuader qu'il doit s'occuper du problème.
*** A la demande de Sloane, Sydney rencontre Emily. Celle-ci lui dit que son cancer aurait pu être soigné, et qu'elle aurait pu espérer guérir, si la peur d'apprendre la vérité sur sa condition ne l'avait pas fait reculer. Cette discussion fait l'effet d'un avertissement à Sydney, qui accepte de se soumettre aux tests de la DSR.
*** Un peu plus tard, Jack annonce à Sydney que les agents de la DSR ne disposent pas de la bonne clef pour déchiffrer le manuscrit : elle se trouve au Vatican. Sydney convainc Vaughn de se rendre en Italie avec elle pour récupérer la fameuse clef.
Tandis qu'ils s'introduisent par effraction dans le Vatican, Vaughn fait remarquer que se trouve à Rome son restaurant préféré, et y invite Sydney. Ils découvrent le code qu'ils sont venus chercher sur le cadre d'un tableau de Rambaldi et parviennent à le photographier avant d'être surpris par des gardes et de devoir s'enfuir. Pas de trattoria romaine pour cette fois !!!
*** Parallèlement, Sloane a découvert que la page 47 qui se trouve dans e manuscrit de Rambaldi est un faux. Furieux, il demande à parler à Sydney. Puis, juste avant la réunion des membres de l'Alliance, il rencontre Briault dans un parc à Montréal et l'abat. Mais lorsque le vote a lieu, la détente est votée à une voix près... celle de Poole. Sloane réalise alors que c'est celui-ci, et non Briault, qui a été acheté par Khasinau.
*** A la CIA, Vaughn fournit la clef pour déchiffrer la prophétie... pour découvrir que la DSR possédait déjà le bon code. Sydney est arrêtée dans une boîte de nuit où elle avait rejoint Francie et Will et la prophétie lui est enfin révélée : d'après Rambaldi, une femme ayant les caractéristiques physiques de Sydney (fréquence et taille de son cœur, séquence ADN, ...) accomplira la prophétie et réduira à néant la plus grande des puissances...